坐落于日本南方的丰饶岛屿，南十字岛。  某天夜晚，一位名叫特纳西・塔科特的少年来到了这座岛屿上。  这个独自从大陆游来的少年，进入岛上的南十字学园高中部学习。性格开朗向上的他遇到了像扬卷・和子、新藤・须方等充满个性的学生并与他们深入交流。  但是，这个南十字学园隐藏着巨大的秘密。  沉睡于地下的，巨大的人型像“赛巴迪”。围绕着这20多个巨像，人们都抱负着各自的秘密。  自称“绮罗星十字团”的谜之秘密结社的暗中活跃，以及巫女们的歌声，还有塔科特自身也抱有着巨大的秘密……。